होमोलॉजी मॉडल का भी उपयोग किया जा सकता है संबंधित प्रोटीन के बीच सूक्ष्म अंतर की पहचान करने के लिए जो सभी संरचनात्मक रूप से हल नहीं किए गए हैं । उदाहरण के लिए, विधि का उपयोग Na+/K+ ATPase पर कटियन बाइंडिंग साइटों की पहचान करने और विभिन्न ATPases की बाइंडिंग आत्मीयता के बारे में परिकल्पनाओं को प्रस्तावित करने के लिए किया गया था।.
होमोलॉजी मॉडल किसके लिए उपयोग किए जाते हैं?
होमोलॉजी मॉडलिंग कम्प्यूटेशनल संरचना भविष्यवाणी विधियों में से एक है जिसका उपयोग अपने एमिनो एसिड अनुक्रम से प्रोटीन 3डी संरचना निर्धारित करने के लिए किया जाता है। इसे कम्प्यूटेशनल संरचना भविष्यवाणी विधियों में सबसे सटीक माना जाता है। इसमें कई चरण होते हैं जो सीधे और लागू करने में आसान होते हैं।
होमोलॉजी मॉडलिंग क्या है और इसकी आवश्यकता क्यों है?
होमोलॉजी मॉडलिंग प्राप्त करता हैटेम्पलेट और लक्ष्य अनुक्रमों के बीच समानता के आधार पर एक लक्ष्य प्रोटीन की त्रि-आयामी संरचना और यह तकनीक तब कुशल साबित होती है जब झिल्ली प्रोटीन का अध्ययन करने की बात आती है कि GPCR की तरह क्रिस्टलीकृत करना कठिन है क्योंकि यह … की उच्च डिग्री की समझ प्रदान करता है
आप होमोलॉजी मॉडल कैसे करते हैं?
होमोलॉजी मॉडलिंग में कई चरण शामिल हैं।
- टेम्पलेट चयन अपने लक्ष्य अनुक्रम का उपयोग करके। इस उद्देश्य के लिए आप सभी उपलब्ध प्रोटीन संरचनाओं (पीडीबी) के खिलाफ BLASTp खोज कर सकते हैं। …
- टेम्पलेट और लक्ष्य अनुक्रम का संरेखण। …
- आपके मॉडल की गुणवत्ता। …
- शोधनअपने मॉडल के अनुसार।
क्या एक अच्छा होमोलॉजी मॉडलिंग बनाता है?
यदि हम एक "अत्यधिक सफल होमोलॉजी मॉडल" को परिभाषित करते हैं, जिसमें अनुभवजन्य संरचना से <=2 rmsd है, तो टेम्पलेट में सफलता के लिए लक्ष्य के साथ >=60% अनुक्रम पहचान होनी चाहिए दर >70%। यहां तक कि उच्च अनुक्रम पहचान (60%-95%) पर भी, दस होमोलॉजी मॉडल में से एक में rmsd >5 बनाम होता है।
